翼三万户，完成了统一蒙古的大业，成为蒙古大汗。达延汗驻察哈尔万户，统率左翼三万户；任命他的三子巴尔斯博罗特为济农，统治右翼三万户。巴尔斯博罗特又将右翼三万户进行了一次调整，任命长子滚必里克•墨尔根为济农，驻鄂尔多斯万户，次子阿勒坦汗为十二土默特万户首领，三子拉布克台吉占据土默特之乌古新，四子巴雅思哈勒，占据永谢布之七鄂托克，五子巴延达喇占据察哈尔之塔塔尔，六子博迪达喇占据阿苏特、永谢布。以上一系列事件和战争，由於大都发生在河套内外，即今鄂尔多斯和土默川地区。所以《明史》上统称之为套虏内战。
元代，包头大青山以南地区隶属大同路云内州管辖，大青山以北属汪古部领地，首府德宁路即今达茂旗敖伦苏木古城。元代包头地区的农业、冶铁业、纺织业、陶瓷业开始兴盛，商业活动随之兴旺。
明王朝建立后，其势力达到阴山以南的广大地区，现今明朝所设州、卫、所废弃。直到隆庆五年（1570年）“隆庆和议”之后，阿拉坦汗归附明朝，被封为顺义王，实行通贡互市，建立“大明金国”，大板升城（今土右旗美岱召）成为其政治中心，也是藏传佛教传播的重要弘法中心。可是这一切也将改写。
土默特部落之名，大体上是在公元1460~1466年间（即明天顺、成化年间）出现的，名多伦土默特。而蒙郭勒津之名，则早在1408-1434年间，阿鲁台时期（明永乐、宣德年间）就出现了。
土默特部又称十二土默特。即十二个部落。它的驻地，明人魏焕《皇明九边考》和贡布扎布《恒河之流》都有记载：满官嗔部下为营八，旧属火筛，今则大酋俺答阿不害（即阿勒坦汗）领之，为营六，曰多罗土闷，曰畏吾儿，曰兀甚，曰叭要，曰兀鲁，日王吉喇“。
多罗土闷（即多伦土默特），在今达茂旗东北部，向西南延伸，至乌拉山一带。原是达延汗四子阿尔斯博罗特的封地。
畏吾儿，原是达延汗七子阿勒布古喇之子不克台吉的封地。畏吾儿部原属永谢布万户，达延汗时调整封地，归阿勒布古喇。阿勒坦汗时又一次调整，成了其孙扯力克和四子丙兔台吉的封地。驻地在今四子王旗中部到大青山北麓。
其他兀慎、叭要、兀鲁、王吉喇、把林、打喇、毛明暗、布喀勒斯、杭锦等部，都驻牧在今察哈尔右翼中旗和凉城县下水海（岱海）以东到河北独石口以西地区。按说张家口以北地区本属永谢布万户，但后来都并入了阿勒坦汗十二土默特的势力范围。各部领
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